Det er ikke hyperbolt å si at CRISPR-Cas9-genredigeringsteknikken har vært et revolusjonerende gjennombrudd som tillater forskere muligheten til å raskt, enkelt og presist redigere deler av DNA. Men spørsmål om hvor presist CRISPR-verktøyet er, er reist i en ny studie fra Columbia University Medical Center, som viser at denne genredigerende teknologien kan introdusere hundrevis av utilsiktede mutasjoner i genomet.
CRISPR har vekket en mengde nye veier med forskning rundt om i verden, fra rettet mot kreft til HIV, Med den første menneskelige forsøk involverer CRISPR-redigerte celler som allerede er i gang i Kina og en amerikansk rettssak planlagt for 2018. Men denne nye studien oppfordrer til å være forsiktig med å komme videre, og antyder at vi fremdeles ikke er i ferd med å forstå de større genomiske effektene av verktøyet.
Teamet av forskere som var involvert i studien, hadde tidligere jobbet med CRISPR-verktøyet for å behandle en alvorlig øyesykdom kalt retinitis pigmentosa, som fører til blindhet. De bestemte seg for å undersøke hele genomet til de CRISPR-behandlede musene fra deres tidligere eksperimenter, og lette etter potensielle mutasjoner, også de som endret bare et enkelt nukleotid.
Generelt sett, når forskere prøver å identifisere om en CRISPR-redigering har resultert i en mutasjon eller sletting utenfor målet, bruker de datamaskinalgoritmer for å identifisere områder som mest sannsynlig vil bli berørt og fokuserer oppmerksomheten mot disse.
"Disse prediktive algoritmene ser ut til å gjøre en god jobb når CRISPR utføres i celler eller vev i en tallerken," sier medforfatter av studien, professor Alexander Bassuk, "men hele genom-sekvensering har ikke blitt benyttet for å lete etter alle off- måleffekter hos levende dyr. ”
Når de undersøkte hele genomet fra de CRISPR-behandlede musene, fant de ut at verktøyet med hell hadde korrigert det spesifikke genet de målrettet seg mot, men det forårsaket også potensielt mye andre genetiske endringer. I to CRISPR-behandlede dyr ble mer enn 100 store gen-delesjoner eller -innlegg og over 1,500 enkeltnukleotidmutasjoner identifisert.
Postet dette på et forum rett ved siden av en endagadget-artikkel om bruk av CRSPR for å lage lysstoffrør beer